سیستم‌های توکسین-آنتی‌توکسین (TA) نوع دوم، دسته‌ای از ماژول‌های TA هستند که در انواع مختلف فرآیندهای سلولی نقش دارند؛ از جمله تشکیل بیوفیلم، پایداری باکتری در شرایط سخت، تحمل استرس، دفاع از سلول باکتریایی در برابر حملات متعدد فاژ، نگهداشت پلاسمید و مرگ برنامه‌ریزی‌شده سلولی به‌منظور بقای جمعیت باکتریایی. اگرچه تاکنون مطالعات بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی متعددی برای بررسی عملکرد سیستم‌های TA شناخته‌شده انجام شده است، اما همچنان نیاز به تحقیقات بیشتری در این زمینه وجود دارد.

ماژول TA نوع دوم RnlAB که از توکسین RnlA و آنتی‌توکسین RnlB تشکیل شده است، نوعی ماژول نوظهور محسوب می‌شود که در مکانیزم دفاعی علیه حمله باکتریوفاژ T4 در سویه Escherichia coli K-12 MH1 شرکت دارد؛ اما این سیستم در سایر باکتری‌ها به‌طور گسترده مورد مطالعه قرار نگرفته است. با توجه به نقش مهم گاماپروتئوباکتریاسه در طیف وسیعی از مشکلات سلامتی، در این پژوهش تمرکز ما بر این کلاس از باکتری‌ها است تا حضور ماژول RnlAB را بررسی کنیم.

برای دسته‌بندی بهتر و توصیف دقیق‌تر توزیع این ماژول در این گروه باکتریایی، در این تحقیق درخت‌های فیلوژنتیک رسم شده‌اند. در این مطالعه از روش‌های همسایگی-پیوستن (Neighbor-joining) و حداکثر صرفه‌جویی (Maximum Parsimony) استفاده شد تا توزیع دومین‌های موجود در پروتئین‌های RnlA و RnlB در میان اعضای گاماپروتئوباکتریا مورد بررسی قرار گیرد. همچنین نقش‌های احتمالی درمان فوتودینامیک (PDT) در فراهم کردن بستری مناسب برای بهبود کارایی فاژتراپی نیز در این مقاله مورد بحث قرار گرفته است.

واژگان کلیدی:
درمان فوتودینامیک ضد میکروبی؛ گاماپروتئوباکتریا؛ ماژول‌ها؛ درخت فیلوژنتیک؛ سیستم RnlAB؛ توکسین/آنتی‌توکسین؛ ماژول TA نوع دوم.